Materiaalitieteen ammattilaiset toteavat, että PET-muovin (polyeteenitereftalaatin) kemialliset ominaisuudet ovat vakaita ja että materiaali ei ole myrkyllistä eikä muutu säilytettäessä lämpötilassa alle 40 °C ja ilmankosteudessa 40–60 prosenttia. Suoraa auringonvaloa ja korkeita lämpötiloja on vältettävä, sillä lämpötiloissa yli 70 °C PET-pullot pehmenevät ja muovaantuvat. Lisäksi jopa elintarvikelaatuiset ja lääkinnälliset pullot, jotka täyttävät lääkkeiden pakkausstandardit, menettävät rakenteellisen kokonaisuutensa. Yksinkertaisin ratkaisu on suljettu ja tuuletettu varasto, jonka ulkoseinillä on varjostuslaitteet ja jossa tuuletus on päällä, jotta estetään paikallisesti pysyvän ilman muodostuminen. Alueilla, joissa ilmankosteus on korkea, käytetään ilmankosteutta alentavia laitteita estääkseen kosteusvesien muodostumisen pullojen pinnalle, mikä aiheuttaa etikettien irtoamista, sekä estääkseen pullojen toissijaisen saastumisen.
Tehokas eräpakkauksen PET-pullojen varastointi osoittaa, että paletin tyyppi ja pinon tiukkuus vaikuttavat suoraan pullojen eheytteen. Tyhjiä elintarvikkeisiin tarkoitettuja PET-pulloja ja kosmetiikkasumuttimia sisältäviä PET-pulloja voidaan pinota enintään kolme kerrosta korkealle koville ja tasaisille muovipaletteille. Korkeammat pinot voivat aiheuttaa pohjan puristusmuodonmuutoksen. Täyteellä varustettujen PET-pullojen pinonta tulisi vähentää yhdellä kerroksella, ja kosketuspintojen väliin tulisi sijoittaa pehmeät törmäyssuojakiskot. Paletti tulisi kiinnittää kokonaisuudessaan venyväksi muoviksi, ja pullojen kaulukset tulisi pitää paletin rajojen sisällä vaurioiden estämiseksi kuljetuksen aikana. Eräpakkaukseen tarkoitetuissa varastointitilanteissa parhaita paletteja ovat standardikokoiset 1,2 × 1,0 metrin paletit, koska ne soveltuvat useimpiin logistiikkakäsittelylaitteisiin ja minimoivat pullojen vaurioitumisen riskin toissijaisessa käsittelyssä.

PU-pullojen luokittelu käyttötilanteiden perusteella on hyvin yleistä, koska varastointivaatimukset vaihtelevat.
Ruokatuotteisiin tarkoitetut PET-pullot, jotka ovat tarkoitettu mehuille ja maidollisille teeteille, on säilytettävä erillään muista tuotteista. Niiden säilytysalue on päällystetty liukumattomalla ja kosteudelta suojatulla lattiamateriaalilla. Ruokatuotteisiin tarkoitetut PET-pullot säilytetään erillisessä, niin sanotussa kabinaatissa, joka sijaitsee vähintään kahden metrin päässä muista kemikaaleja ja torjunta-aineita merkityistä pulloista ristisaastumisen estämiseksi. Lapsiturvallisilla korkkeilla varustetut lääketieteellisen laadun PET-pullot on säilytettävä lukittavassa kaapissa. Kaapin sisällä on yksi sisäinen hylly, jotta lapsiturvallisen sulkeuman irtoamisen riski pienenee. Kosmetiikkalogolla varustettu spray-pullo on säilytettävä vaahtomuovipadauksessa, jotta pullon liikkuminen minimoituu. Muiden tuotteiden logojen naarmuuntumisen estämiseksi mukautetut logotuotteet on pakattava yksittäin. Tällainen säilytystapa mahdollistaa tehokkaan tilausten kokoamisen tai lajittelun varastossa.
PET-pullojen tukkukauppa ja eräkohtainen varastointi vaativat tiukkaa eräkontrollia ja laatuinspektioita. Jokainen tukkukaupan PET-pulloerä on merkittävä ostopäivällä, tuotteen teknisillä tiedoilla ja sovellettavilla kategorioilla, ja erät on varastoitava eräkohtaisesti selkeästi erotettuihin alueisiin varastossa. Inspektion on suoritettava kolmen päivän välein, ja siihen on kuuluttava tarkastukset muovautuneista pullon kehoista, ehjistä sinetreistä ja täydellisestä merkinnästä. Yli kuukauden ajan varastoitujen PET-pullojen osalta on tehtävä satunnaisnäytteitä pullon kehon tiukkuuden ja rakenteellisen eheytetyn tarkistamiseksi. Esimerkiksi 60 ml:n spray-PET-pulloissa erän näytteenottosuhteen on oltava vähintään 1 %, ja vialliset tuotteet on poistettava ja eristettävä estääkseen niiden saastuttamasta tuotanto- ja käyttöketjua. Tämä standardointimenetelmä voi huomattavasti varmistaa tuotteen laadun ja yhdenmukaisuuden vähentämällä viallisten PET-pullojen määrää varastoinnin aikana.
Vaatimustenmukaisen varastoinnin ja kustannussäästöjen yhdistäminen tarjoaa tieteenperäisen varastoinnin avulla keinon varmistaa suurten määrien PET-pullojen laadun säilyttäminen. Yhdessä toiminnallisen terveyden ja turvallisuuden hallintajärjestelmän kanssa varasto on noudatettava tulipalon estämiseen liittyviä vaatimuksia turvalliselle muovivarastoinnille. Esimerkiksi varastossa on oltava turvallisuusmerkintöjä ja palo sammuttavia laitteita sekä varastointialueita, joissa ei ole avointa liekkiä tai kuumia laitteita. Lisäksi PET-pulloja on järjestettävä niiden myynti- ja käyttötaajuuden perusteella, jotta nostotehokkuutta parannetaan: nopeasti myytävät tuotteet sijoitetaan lähelle varaston sisään- ja uloskäyntiä. Alan tiedot viittaavat siihen, että optimaalisesti tiloitetun ja tieteellisesti perustellun varastoinnin sekä suurten määrien PET-pullojen luokittelun avulla vahingoittuu alle 1 % pulloista ja varastointikustannuksista hukataan alle 1 %. Lisäksi kansainväliset pakkausmateriaalien varastointistandardit voivat vähentää mahdollisia viivästyksiä tullin tarkastuksen aiheuttamana rajat ylittävässä PET-pullojen tukkukaupan toimitusketjussa.
PET-pullojen whole-sale- ja pitkäaikainen rajat ylittävä varastointi edellyttää erityisiä huomioita. Perusympäristöhuomiot ja pinontarajat huomioiden pakkaaminen kuivissa tiloissa tehdään staattista sähköä estävällä kalvolla, joka vähentää staattisen sähkön aiheuttamaa pölyn tarttumista pullon pinnalle ja näin ollen vaikutusta ulkonäköön ja toimintakykyyn. Rajat ylittävässä, pitkäaikaisessa varastoinnissa ja kuljetuksessa korkean lämpötilan ja kosteuden alueilla on käytettävä kosteudenimeytyspussien lisäksi PET-pullojen tiukasti suljettua pakkausta sekä säilytystilojen lämpötilan ja kosteuden säätöä, jotta voidaan luoda vakaa ympäristö. Kansainvälisten kuljetus- ja varastointiyhtiöiden kanssa tehty yhteistyö mahdollistaa reaaliaikaiset päivitykset varastoinnin ja kuljetuksen aikana, mikä mahdollistaa suojatoimenpiteiden sopeuttamisen ympäristöolosuhteisiin. Lopputuloksena massamaiset PET-pullot saapuvat vahingoittumattomina määränpään varastoon.