Професионалци из науке о материјалима кажу да су хемијска својства ПЕТ-а (полителентерефталата) стабилна и да материјал није токсичан и да се не мења када се чува на температури и влажности испод 40 степени Целзијуса и влажности од 40 до 60 посто. Неопходно је избегавати директну сунчеву светлост и високе температуре јер ће се на температурама изнад 70 степени Целзијуса ПЕТ флашице омекшати и деформисати. Осим тога, чак и флаше за храну и медицинске производе које су у складу са фармацеутским стандардима упаковања изгубеће свој структурни интегритет. Најједноставније решење је да се има затворен и вентилисан складиште са сенка уређаја на спољним зидовима и вентилација укључена да се избегне преовладавање стагнираног ваздуха. За подручја са високом влажношћу окружења, деугидификери се користе како би се избегло кондензацију на површини флашица, што доводи до одвајања етикета, и да се избегне секундарна контаминација флаше.
Ефикасно складиштење бутилка ПЕТ-а у оптовари указује на то да врста палете и густина складиштења имају директен утицај на интегритет бутилка. Пусте ПЕТ флаше за храну и ПЕТ флаше са козметичким спрејем могу се наносити на чврсте и равне пластичне палете. Виши слојеви могу изазвати деформацију основе екструзијом. Наплављене ПЕТ флаше треба смањити за 1 слој и на контактне површине треба ставити меке анти-колизијске подложке. За фиксацију палете као целине треба користити протегли филм, а врато флаке треба да остане у границама палете како би се избегло оштећење током транзита. За складиштење бунара, најидеалније палете су стандардне палете величине 1,2 × 1,0 м, јер су погодне за већину логистичких уређаја за руковођење и минимизују ризик од оштећења бочица током секундарног руковања.

Класификација на основу сценарија примене је веома уобичајена за ПУ флаше због различитих захтева за складиштење.
ПЕТ флашице за храну намењене за сокове и млечне чајеве морају се чувати одвојено од других производа. Подручје на коме се чувају је обложено нескочивим и невлажном патером. ПЕТ флашице за храну се чувају у одвојеној кутији која је више од 2 метра од других флашица са етикетама хемикалија и пестицида како би се спречило било какво крстовно загађење. ПЕТ флашице медицинског квалитета са капачем заштите од деце треба чувати у закључаном ормару. За складиштење ормара, постоји једна унутрашња полица како би се смањио ризик од одласка запечатице за децу. Козметичка флашка за спреј са логотипом треба чувати са пеновим облогом како би се смањило кретање флашица. За производе са прилагођеним логотипом, како би се спречило скрепирање логотипа, они треба да буду појединачно упаковани. Такво складиштење омогућава ефикасно одабирање или сортирање наруџбина у складишту.
Трговање на рубљи и складиштење ПЕТ флашира на велико захтевају строгу контролу партија и инспекције квалитета. Свака серија продајних ПЕТ флаши треба да буде означена датом куповине, спецификацијама производа и применим категоријама и складиштена по серији на јасно подељеним подручјима у складишту. Инспекције треба да се обављају сваких три дана и треба да укључују проверу деформисаних тела флашица, нетакних пломбица и комплетне ознаке. За ПЕТ флаше које су складиштене дуже од једног месеца, треба да се произвољно узме узорак како би се тестирало чврстоће и структурни интегритет тела флаше. На пример, за 60 мл питеролинске флаше за прскање, стопа узорка за партију треба да буде најмање 1%, а дефектни производи треба да се уклоне и изоловају како би се спречило да контаминирају производње и употребу. Овај метод стандардизације може значајно осигурати квалитет и конзистенцију производа смањењем стопе дефектних ПЕТ флашица током складиштења.
Склањање у складу са прописом, заједно са уштедом трошкова, нуди начин да се осигура квалитетно очување буклета ПЕТ са складиштењем на велико путем научног складиштења. У комбинацији са оперативним системом управљања здрављем и сигурношћу, складиште мора да испуњава захтеве о пожаровној безбедности за сигурно складиштење пластике. На пример, складиште треба да има безбедносно знакове и опрему за гашење пожара, као и зоне складиштења које су слободне од отворених пламена и вруће опреме. Такође, пластичне ПЕТ флаше треба да се распореде на основу њихове продаје и учесталости употребе како би се повећала ефикасност пицкинга, тако да се брзе сорте налазе најближе улазу и излазу складишта. Подаци из индустрије указују на то да оптимално растојано научно складиштење и класификација бубрежних ПЕТ флаши оштећује мање од 1% флаши и губи мање од 1% трошкова складиштења. Такође, међународни стандарди складиштења паковачких материјала могу смањити потенцијална кашњења због царинског обрада током прекограничног ланца снабдевања велепродаје ПЕТ флаши.
Посебне су потребе за општом и дугорочним прекограничним складиштењем ПЕТ флашица. Поред основних еколошких разматрања и граница складиштења, паковање у сувим подручјима користи антистатички филм како би се смањило привлачење статичке прашине на површину флаше која утиче на изглед и функцију. Трансгранично, дуготрајно складиштење и транспорт у подручјима са високом температуром и влажношћу захтевају употребу паковања који апсорбују влагу у запечаћеној амбалажи ПЕТ флашица, као и контролу температуре и влаге у подручју складиштења како би се створило константно окру Партнерство са међународним компанијама за транспорт и складиштење како би се добиле ажуриране информације у реалном времену током складиштења и транспорта омогућило би прилагођавање заштитних мера околини. Крајни резултат је да ће буклети од ПЕТ-а стићи, неповређене, на складиште на коме се налазе.